TrueNAS SCALE 确实禁用了包管理工具，如 apt，这是为了确保系统的稳定性和兼容性。手动更新或安装新软件包可能会破坏 TrueNAS SCALE 的核心功能，甚至导致系统无法正常工作。因此，建议通过 TrueNAS SCALE 的 Web 界面进行所有系统更新和软件安装。
建议的方法：

使用 TrueNAS 应用商店：TrueNAS SCALE 提供了一个内置的应用商店（"Apps"），可以安全地安装和管理各种应用和插件，包括 Docker 容器。
系统更新：通过 TrueNAS 的 Web 界面进行更新，路径是：System Settings > Update，可以确保获得官方支持的更新。
自定义需求：如果确实需要额外的软件功能，建议在 TrueNAS SCALE 上使用 Docker 或 Kubernetes 功能。这些容器化的应用与系统隔离，可以避免直接修改底层系统。

通过这种方式，您可以避免潜在的问题并保证 TrueNAS 系统的稳定性。